Bitlis’te doğan Fuat Sezgin’nin Babası Mirza Mehmet Efendi,annesi Cemile Hanımdır.1936 yılında ilkokulu Doğubeyazıt’ta okudu. Babası Mirza Mehmet Efendi’nin vefatı üzerine Bitlis’e giderek, 1939 yılında burslu ve yatılı olarak ortaokulu ,1942 yılında ise yine burslu ve yatılı olarak Erzurum Lisesi Fen Bölümü’nü bitirdi.1943 Yılında üniversite eğitimi için İstanbul’a geldi .Mühendislik okumak istiyordu,ancak bir yakınının tavsiyesiyle
1943-51 yılları arasında İstanbul Üniversitesi Edebiyat Fakültesi Şarkiyat Enstitüsü‘ nde “İslami Bilimler ve Oryantalizm”alanında otorite sayılan Alman oryantalist Hellmut Ritter’in yanında öğrenim gördü.Bilimlerin temelinin,”İslam bilimleri”ne dayandığı tespit ederek,1951 yılında Arap Dili ve Edebiyatı üzerinde doktara yaptı.1954’te Arap Dili ve Edebiyatı Bölümü’nde,”Buhari’nin Kaynakları” adlı doktor tezini tamamlayarak doçent oldu.Bu teziyle o,hadis kaynağı olarak İslam kültüründe önemli yere sahip Buhari’nin,bilinenin aksine sözlü kaynaklarda değil,”yazılı kaynaklara dayandığı”tezini ortaya attı. 1960 yılında Türkiye’de askerî darbe ile iktidara gelen hükümet tarafından 147 akademisyenin üniversitelerden ihraç edildiği listede kendi adının da bulunmasından ötürü Sezgin, çalışmalarına yurtdışında devam etmek durumunda kaldı.
1978 yılında “Kral Faysal”ödülünü kazandı.Bu vesileyle Arap dünyasının devlet adamları ile tanıştı ve aklından geçen büyük projeleri onlara aktarma imkanı buldu. Ömrünü ilme adamış,eşine az rastlanır azmi ve çalışkanlığı ile geriye çok değerli eserler bırakan ,bilim insanı 30 Haziran 2018 yılında 94 yaşında vefat etmiştir.Kabri Gülhane İslam Bilim ve Teknoloji Tarihi Müzesi’nin bahçesinde bulunmaktadır.
